觉囊派是藏传佛教宗派之一，在诸多宗派中在教义方面有自己独到的学派观点，因而在藏传佛教史上引起过争议。

由于觉囊派以“他空见”为主要学说，故其学说渊源说追溯到域摩·弥觉多杰（约１２世纪初）。域摩·弥觉多杰**初是一位在家的瑜伽修行者，后来出家并改名为丹巴杰布，并从克什米尔的班钦·达瓦贡布及其弟子卓敦·南拉孜等高僧大德前学习《时轮本续经》、《集密》等深奥密法，始大彻大悟，并著述《时轮》法要。他空教义传到域摩·弥觉多杰的第五传弟子贡邦·特杰尊珠（１２４３——１３１３年）时，这位高僧在后藏拉孜东北的觉摩囊建立一座寺院，该寺被称为觉囊寺，以此为根本道场而形成的宗派，就取名为觉囊派。贡邦·特杰尊珠的门徒中有一位杰出人物，即凯尊·云丹坚赞（１２６６——１３２７年），他继承觉囊派法嗣并精心培养了一名后继者，这就是著名的觉囊派高僧多朴巴·喜饶坚赞（１２９０——１３６１年）。在喜饶坚赞主持法统期间，觉囊派有所发展。此后觉囊派一度趋于消沉，后来觉囊派中出现一些著名人物，觉囊派又开始兴盛起来，诸如觉囊·贡噶卓乔（１５０７——１５６９年）、觉囊瓦·多罗那他（１５７５——１６３４年）等。特别是觉囊瓦·多罗那他对觉囊派的复兴作出特殊贡献。

    相传多罗那他是贡噶卓乔的转世，原名叫贡噶宁布，出生于前后藏交界处的喀热琼增，幼年在觉囊寺学经，后游历藏区各地，广拜名师研习显密教法，三十岁受比丘戒，成为觉囊派的一名高僧，并得到拉堆绛地方首领（万户）的支持。１６世纪后半叶，拉堆绛地方势力衰落后，又受到第司·藏巴汗的扶持。因此，多罗那他于１６１４年在觉囊寺附近创建了一座规模不小的新寺，即著名的达丹彭措林寺。从此觉囊派又开始出现欣欣向荣的景象。多罗那他建立达丹彭措林寺不久，便受到外蒙古汗王的邀请，在漠北库伦（今乌兰巴托）一带传教约达二十年之年，并得到喀尔喀部的信奉和支持，而且在当地建造不少寺庙。**后多罗那他蒙古地区的广大信徒尊称为“哲布尊丹巴”。从此，多罗那他在漠北库伦一带享有崇高的地位。１６３４年多罗那他在库伦圆寂，次年喀尔喀部土谢图汗王适得一子，被认定为多罗那他的转世，成为****世哲布尊丹巴活佛。

    目前，在四川阿坝州壤塘县境内的觉囊派寺院主要有壤塘寺（是觉囊派的三大寺庙藏洼寺、确尔基寺、泽布基寺的合称）夏炎寺、红土寺、日梭寺、尕牙塘寺、屈塘寺、中壤塘寺和贡布拉岗等七座寺院。

 马尔康县主要有黑尔木亚寺、干木鸟寺、巴朗寺、康山寺、颜木底寺、扎西日岗寺和让古寺等；阿坝县主要有色贡巴寺、孜朗寺、塔尔么寺、雅贡寺和阿华寺。

     青海省果洛藏族自治州甘德县境内的觉囊派寺院主要有扎西曲朗寺，现有７０名住寺僧人。降什加寺，现有７０多名住寺僧人。恰依龙寺，现有常住寺僧２５人，在寺内举行宗教活动时，僧众达１４５人。

     在果洛州班玛县境内的觉囊派寺院主要有阿什姜贾贡寺，现有５０住寺僧人，其中活佛２人。浪本寺，现有４６名住寺僧人。

 在果洛州久治县境内的觉囊派寺院主要有尖姆寺，现有常住寺僧１００人，而所属社会流散僧侣有２００多人。宁支寺，现有６５名住寺僧人。实际上，该寺是一座融格鲁派和觉囊派为一寺的特殊寺院，时常由两派僧人共同举行佛事活动。